Станция располагает различными коллекциями и экспозициями: арборетумом в 550 таксонов (в т.ч. «старым арборетумом» – 1 га, 50 пород; «новым арборетумом» – 3,3 га, около 260 пород; «хвойным участком» – 0,7 га, 31 порода; фрутицетумом «крымско-новороссийское ксерофильное криволесье» – около 1 га, до 200 пород); каменистой горкой (около 150 видов), коллекцией травянистых многолетников (около 500 таксонов), лекарственными растениями (около 120 видов). В коллекциях сохраняются 132 редких вида, из них 99 представляют флору Кавказа, 110 входят в Красную книгу РФ (в т.ч. 12 – относятся к категории 1 (Е): виды, находящиеся под угрозой исчезновения: пион Витмана Paeonia wittmanniana, подснежник Борткевича Galanthus bortkewitschianus, иглица колхидская Ruscus colchicus, беламканда китайская Belamcanda sinensis и др.).

Основные направления исследований: интродукция растений, изучение флоры Северного Кавказа, охрана растительного мира региона Кавказских Минеральных Вод (КМВ). Описано 20 новых видов сосудистых растений Кавказа. По заказам местных органов власти проведены: эколого-ботаническая экспертиза территориальной комплексной схемы охраны природы региона КМВ по разделу «Охрана растительного мира региона» (1988г.); экспертиза обоснования границ памятника природы «Гора Машук»(1990г), генерального плана г. Пятигорска (1991г.), заказников «Баталинский минеральный источник» (2001г.) и «Тамбуканское озеро лечебной грязи» (2002г.); зонирование территории г. Пятигорска для природоохранных целей (2004г.). Проводится работа по реинтродукции охраняемых видов родов ирис, катран и эремурус в природу. Коллекции сада предоставляются школьникам, студентам и аспирантам для проведения научных исследований по древесным, лекарственным, декоративным и редким растениям. Проводятся экскурсии для различных категорий населения.

Перкальский дендрологический питомник - один из интереснейших памятников пятигорской природы, расположенный на северном склоне горы Машук. Дендрарий занимает 9,3 га. Основан в 1879 году, с целью внедрения древесно-кустарниковых пород для озеленения курортов КМВ. На территории произрастает много видов растений, включенных в Красные Книги Российской Федерации и Ставропольского края.

Академия наук на территории заповедника обосновалась с 1982 года. Однако, на этом склоне Машука различные экзотические деревья выращивают уже более 150 лет. Старожилам это место известно как Перкальский арборетум.

Столь любопытное название объясняется весьма просто. Экзотическое для русского уха название "арборетум", является всего лишь синонимом понятия "дендрарий". Ведь здесь произрастает целая коллекция древесных и кустарниковых растений, созданная в научных, познавательных или учебных целях.

Название Перкальский произошло от искаженной польской фамилии Перхальский. Участник Польского восстания 1830-31 годов, высланный в качестве наказания, в звании рядового на Кавказ. В 1832 году Перхальский был определен на должность объездчика Бештаугорской лесной дачи, когда российский комитет по лесной части набирал в лесную стражу людей из военного ведомства. Место жительства ему обозначили на северном склоне Машука, после чего его фамилия и закрепилась за этой местностью.