Соянский государственный природный биологический заказник регионального значения образован с целью сохранения озерно-речной системы реки Сояна, воспроизводства и восстановления численности диких животных, редких и исчезающих видов растений, животных и других организмов, ценных в хозяйственном и научном отношении видов рыб, среды их обитания и поддержания общего экологического баланса охраняемой территории, в том числе при осуществлении использования территории заказника.

На территории заказника произрастают сосновые насаждения, по типу леса – лишайниковые, являющиеся кормовой базой северных оленей. Но наличие в кварталах дорог, близость промышленной разработки месторождения алмазов и высокая посещаемость людей отрицательно влияют на животных, которые плохо приспосабливаются к фактору беспокойства и перестают посещать эти места. На территории заказника имеются ценные участки, представленные выделами с наличием в них реликтовых и эндемичных растений. К ним относятся участки леса, в составе древостоя которых имеется 30 и более процентов лиственницы.

Практически вся территория заказника является участком малонарушенных лесных ландшафтов, являющихся естественной средой обитания жизнеспособных видов флоры и фауны. Крупные массивы малонарушенных лесов имеют особую природоохранную ценность в связи с тем, что они являются эталонами дикой природы и способствуют поддержанию естественных экологических процессов на обширных территориях. Они включают в себя основной набор типичных лесных ландшафтов и представляют собой среду обитания как редких и исчезающих, так и для типичных в лесной зоне популяций растений и животных.

На территории заказника выделяют 3 вида основных экосистем: лесные, болотные и озерно-речные. Лесами покрыто около 79 % площади заказника, здесь преобладают хвойные древостои старше 150 лет – ельники, сосняки, лиственничники. Березняки распространены достаточно широко, осинники встречаются редко.

Болота занимают до 17 % площади Соянского заказника и являются неотъемлемым компонентом его ландшафтов. Часть их массивов относится к типу аапа. Эти болота имеют высокую научную ценность, так как почти не изучены в нашей области. Верховые сфагновые болота выполняют ландшафтообразующую роль, занимают обширные понижения в рельефе, на них берут начало многочисленные ручьи. Это важные кормовые угодья для птиц и таежных животных, ценные ягодники. Флора болот в целом бедна, но вместе с тем она очень разнообразна. Встречаются такие редкие и исчезающие виды мхов, как сплахнум бутылковидный, сферический, желтый, тетраплодон мниевидный, гаммарбия болотная, ситник стигийский, меезия трехгранная, тиммия баварская, энкалипта полосатоплодная, сэлания сизоватая и другие виды, внесенные в Красную книгу Архангельской области.

По территории заказника протекают семужьенерестовые реки: Сояна, Ерюга, Верхняя Кучема, Большая Турья, Котуга, Кепина, Ерна, Нижняя Кучема.

В Соянском заказнике обнаружено 14 видов растений, внесенных в Красную книгу Архангельской области, из которых 1 вид – башмачек настоящий – внесен в Красную книгу РФ. Здесь встречается 8 видов редких животных: скопа, беркут, орлан-белохвост, филин, серый сорокопут – внесены в Красную книгу России, а также бородатая неясеть, длиннохвостая неясыть и летяга – в Красную книгу Архангельской области.

Территория заказника характеризуется умеренно-континентальным климатом. Наблюдается сильное влияние арктических воздушных масс и атлантических циклонов. Поэтому изотермы января имеют направление, близкое к меридиональному, из-за отепляющего влияния Атлантики, а июля - к широтному, из-за воздействия арктических воздушных масс. В летний период не редки заморозки, преобладают ветра северо-западного направления, которые приносят большое количество осадков (2/3 годовой нормы осадков). Среднегодовая температура воздуха составляет +1,2º. Период положительных температур – 148 дней, вегетационный период (с температурами выше +5º) – 125 дней с конца мая по конец сентября. Активная вегетация начинается с превышением среднесуточной температуры +10º в середине июня и заканчивается в конце августа (продолжительность – 73 дня). В течение года выпадает 450-520 мм осадков. Снежный покров устанавливается в начале октября и держится до конца мая. Глубина сезонного промерзания почв колеблется от 30 до 70 см.

Соянский заказник пересекает с юго-запада на северо-восток Беломорско-Кулойское плато, расположенное на склоне Балтийского щита вблизи пассивной континентальной окраины Восточно-Европейской платформы. В строении площади резко обособлены два структурных этажа - сложнодислоцированный архей-нижнепротерозойский фундамент, породы которого вскрыты структурными скважинами на глубинах 538-860 м и осадочный чехол Мезенской синеклизы. Фундамент сложен породами беломорского комплекса архея (амфиболитовая фация метаморфизма). В осадочном чехле, залегающем с угловым и стратиграфическим несогласием на породах фундамента, выделяются рифейский, байкальский, герцинский и киммерийский структурные ярусы. В районе развит довольно широкий комплекс магматических образований, как в породах фундамента, так и в осадочном чехле. Магматические образования в кристаллическом фундаменте вскрыты единичными скважинами, поэтому выделяются по геофизическим данным. Трубки взрыва железисто-титанистой серии развиты в основном в бассейнах рек Пачуга, Кепина и Сояна, где образуют несколько сближенных полей кимберлитового и пикритового состава. Современные тектонические движения, выделенные по материалам изучения осадков и рельефа, делятся на эпейрогенные (колебательные, ритмически-колебательные), волновые и блоковые. Согласно геоморфологическим, гидрогеологическим и геотермическим критериям в современном рельефе территории разрывы находят свое отражение в виде прямолинейных уступов и переломов склонов междуречий, спрямленных участков морских террас и береговых линий современных и древних морей, лагун, озер, речных долин и болот.

На рассматриваемой территории, возможно, выделить в общем плане структурно-денудационный и денудационный (скульптурный) генетические типы рельефа. От верховьев реки Золотицы до реки Пинеги и от реки Мелы до реки Ижмы на площади - около 20000 км2 геологоразведочными работами выявлено около 60 древних вулканических аппаратов, 46 из них сложены породами кимберлитовой формации, 12 – вулканами базальтов. И те и другие образуют преимущественно трубки взрыва, реже – дайки и силлы, у некоторых трубок сохранились кратерные части. Размеры трубок - от 60 до 2000 м, форма - от изометричной до удлиненной. Кимберлиты глиноземной серии формируют Золотицкий куст, состоящий из 10 трубок - Первомайской, Белой, Кольцовской, Ломоносовской, Поморской, Пионерской, Карпинского-2, Карпинского-1, Архангельской и Снегурочки. Наиболее богатые из них, кроме первых трех, входят в месторождение им. М.В. Ломоносова. К этой серии относятся также флагопитовые киммелилиты Верхотинского куста (трубки 401-с, 401-ю, 402, 407, 685, 823А). Алмазоносные кимберлиты железотитанистой серии представлены пока одной трубкой им. В.П. Гриба, остальные кимберлиты этой серии убогоалмазоносные (трубки 688, 693, 751, 748, силлан. 734). Кимберлиты глиноземной и железотитанистой серий алмазоносны.

Месторождение округлых алмазов разведано в кимберлитовых трубках Al серии - Золотицкий куст, месторождение им. Ломоносова, разведается месторождение алмазов и в кимберлитовой Fe-Ti трубке им. В.П. Гриба. Мелилититы, пикриты и породы промежуточного типа обеих серий района убогоалмазоносны или неалмазоносны. Малые по запасам месторождения песков для возведения насыпей разведаны в верховьях р. Золотицы и на левом берегу р. Кепина. Площади развития пресных кондиционных вод приурочены к возвышенным частям территории с абсолютными отметками выше 60-140 м, где мощность зоны пресных вод максимальна – до 200-250 м.

Основными водоносными комплексами являются комплексы песчаников и алевролитов падунской свиты венда и карбонатных пород среднего-верхнего карбона и ассельского яруса нижней перми, представленные известняками и доломитами с редкими прослоями гипсов. На площади развития пресных кондиционных вод могут быть размещены водозаборы для централизованного водоснабжения таких крупных городов, как Архангельск, Северодвинск и Новодвинск. Наиболее подходящим местом для их сооружения являются долина верхнего течения р. Пачуга и оз. Пачозеро.

Здесь находится Пачугское месторождение пресных подземных вод с прогнозными запасами порядка 500 тыс. м3/сут. Месторождение приурочено к площади развития карбонатных отложений ассельского яруса нижней перми и верхнего - среднего карбона. Подземные воды имеют высокое качество.

На правом берегу р. Сояны в ее среднем течении в урочище Ивагора расположено обнажение верхнепермских отложений высотой - до 100 м, и протяженностью – 400 м, известное под названием Ивагорское или Ивагора. В 1926 г. М.Б. Едемский нашел первые отпечатки насекомых и растительные остатки в ивагорской свите на Ивагоре и в расположенном в двух километрах ниже по реке обнажении Шеймогора. В 1935 г. Я.Д. Зеккелем открыты новые месторождения пермских насекомых в обнажениях по рекам Большая и Малая Летопала – правым притокам р. Сояны вблизи Ивагоры. Им же сделано послойное детальное описание Ивагоры, пачка мергелей в основании казанских отложений выделена в ивагорскую фацию. Наиболее насыщенным оказался трехсантиметровый прослой в основании пачки мергелей. С 1928 г. до конца 30-х годов изучением пермских насекомых р. Сояны занимался А.В. Мартынов. Только в отряде Mecoptera им установлено 25 видов, в 1936 г. он описал 37 новых видов и один новый род, были определены и новые семейства. По оценке А.В. Мартынова к 1938 г. на Соянских местонахождениях было найдено около 5000 отпечатков насекомых. Среди них большую часть составляют цикады, разнообразные прямокрылые, протоперларии, скорпионницы, сеноеды. Меньшую роль среди соянской фауны играют стрекозы, сетчатокрылые, прыгающие прямокрылые и жуки. В 1960 г. в работе Е.Э. Беккер-Мигдисова только среди равнокрылых описала 14 родов и 30 видов, из них 6 новых родов и 17 новых видов. Стратотипические разрезы верхней части турьинской свиты, представленные светло-серыми песчаниками с прослоями розовато-серых и оранжевых мелко- и среднезернистых песчаников, преимущественно чисто кварцевых с карбонатно-глинистым цементом вскрываются в нескольких обнажениях высотой до 15 м по правому берегу р. Большая Турья.

В приустьевой части р. Большая Турья и ниже ее на правом берегу р. Сояны на турьинских песчаниках залегает пачка мощностью до 10 м своеобразных водорослевых известняков, представленных биогермами. Тела биогерм выполняют желтовато-белые сахаровидные микрослоистые известняки, изобилующие порами кавернами. В них М.А. Калмыковой обнаружены пермские водоросли. Известняки выделены в перекатские слои - фациальный аналог кулогорской свиты стерлитамакского горизонта сакмарского яруса, венчающий в регионе разрез нижней перми. Стратотипическими разрезами, по мнению А.Ф. Станковского, являются зоны контактов между уфимским и казанским ярусами верхней перми в обнажениях по рекам Сояне и Лаке в пределах Беломорско-Кулойского плато. В первую очередь - это Ивагорское обнажение с его уникальным местонахождением пермских насекомых. В 20 км выше Ивагоры на левобережье Сояны в 0.5 км от реки имеется обнажение под местным названием «Под оленем», где наряду с прекрасно выраженным контактом между уфимскими и казанскими отложениями в верхах первых зафиксирован прослой конгломератов мощностью до 1.5 м неясного стратиграфического значения.

В 20 км выше Ивагоры также на левобережье Сояны в 1 км от реки в верховьях ручья А.Ф. Станковским впервые в 1974 г. было обнаружено красивейшее в виде цирка высотой до 30 м, обнажение, вошедшее в отчет под названием Верхние Кокоры. Здесь же вскрывается зона контакта уфимских и казанских отложений, в последних отложениях найдены многочисленные остатки фауны и отпечатки пермской флоры. Ниже Ивагоры по обоим берегам р. Сояны до выхода ее за пределы плато известна серия прекрасных обнажений высотой до 40-50м (Дивись-гора, гора Александриха и др.), в которых вскрываются разрезы, близкие ивагорскому. Аналогичные многочисленные обнажения описаны в среднем течении р. Лаки, где ярко выраженный контакт уфимских и казанских отложений четко фиксирует типично платформенную пологую синклинальную складку с размахом крыльев до 1 км. На территории плато широко развиты подземные и поверхностные формы карстового рельефа, в пределах которых формируются неповторимые карстовые ландшафты.

К ландшафтным памятникам природы относятся: поля воронок, шелопняки (участки открытого карста), каньонообразные участки долин рек, суходолы, карстово-денудационные долины, карстовые лога, карстовые озера, котловины, провалы, цирки, останцы, арки, пещеры и др. Значительно количество карстовых объектов претендует по своей уникальности на ранг памятников природы, входящих во Всемирное наследие. Поверхностный карст и пещеры обладают значительным экономическим, научно-информационным и спелеоресурсным материалом.

Соянский заказник располагается в Сояно-Кепинском районе небольших исчезающих озер Пинега-Нижнедвинского округа Онего-Двино-Мезенской области Страны Русской Равнины. На территории Соянского заказника выделяются 3 вида основных экосистем: лесные, болотные, озерно-речные. Заказник расположен в зоне северной тайги. Лесами покрыто около 79 % площади заказника, где притундровые леса занимают площадь 175 165 га. Уникальность лесов на Беломорско-Кулойском плато определяется тем, что это один из немногих, сохранившихся в малонарушенном виде, обширный массив леса.