Территория заказника расположена в районе границы Мещерской и Московской физико-географических провинций в зоне распространения моренно-водноледниковых и древнеаллювиально-водноледниковых волнистых и слабоволнистых, влажных и сырых равнин. Дочетвертичные породы местности представлены известняками, доломитами, мергелями, глинами, алевритами, песками и песчаниками каменноугольного периода, а также глинами юрского возраста. Абсолютные высоты в границах заказника изменяются от 147 м над уровнем моря (в долине ручья в юго-западном углу территории) до 156,6 м над уровнем моря (в возвышенном участке равнины на северной границе территории).

Заказник включает плоские поверхности моренно-водноледниковых равнин, расположенные на приводораздельной поверхности рек Вори и Клязьмы. Равнины с поверхности сложены суглинками с гравием, галькой и валунами. Территория характеризуется выровненным рельефом со слабым наклоном (1-2°) поверхности на юг.

По территории заказника с севера на юг протянулись две ложбины с переувлажненными днищами. По днищам протекают временные водотоки, характеризующиеся небольшой шириной (до 30 см) и глубиной не более 5 см. Юго-западная оконечность территории включает также небольшой фрагмент долины ручья. В днищах ложбин наблюдаются процессы биогенного рельефообразования, в том числе формирование растительных кочек, искорей и высоких приствольных повышений. Помимо флювиальных форм рельефа поверхности равнин в границах заказника местами осложнены слабовыраженными в рельефе котловинами и западинами. Некоторые из них имеют правильные формы и антропогенный генезис.

Гидрологический сток на территории заказника направлен в реку Любосеевку – правый приток реки Вори (приток реки Клязьмы). Юго-западная и юго-восточная оконечности территории включают фрагменты копаных водоемов.

Почвенный покров на территории заказника представлен преимущественно дерново-подзолистыми и дерново-подзолисто-глеевыми почвами. В пределах переувлажненных понижений встречаются торфяно-подзолисто-глеевые почвы.

В растительном покрове заказника выделяются две части или полосы – северная – малонарушенная, и южная, затронутая вспышкой короеда-типографа.

Основу растительного покрова заказника составляют берёзово-сосновые и сосновые с елью во втором ярусе, реже – елово-сосновые, кислично-широкотравные и широкотравно-кисличные леса. Небольшими участками встречаются чернично-кисличные и костянично-широктравно-кисличные леса. В древостое, как правило, чётко выделяются два подъяруса. Верхний высотой 24-25 м и сомкнутостью 0,5-0,6 образован сосной при участии берёзы с примесью осины. Диаметр отдельных сосен достигает 75 см. Второй, почти исключительно еловый, высотой 14-15 м и сомкнутостью 0,4-0,5. В подросте единично представлены ель, осина и дуб. Как правило, имеется довольно выраженный подлесок из рябины (35-40 процентов); единично встречаются лещина и жимолость лесная. Для густого (проективное покрытие до 100 процентов) травяно-кустарничкового яруса характерно сочетание таежных (кислица обыкновенная, костяника, щитовник картузианский, или игольчатый, черника, брусника, седмичник европейский, майник двулистный, ортилия однобокая, грушанка круглолистная, мицелис стенной, ожика волосистая) и дубравных элементов (осока волосистая, копытень европейский, зеленчук жёлтый, подмаренник душистый, сныть обыкновенная), единично встречается ландыш майский.

Среди лесов встречаются небольшие протяжённые локальные понижения с безлесными «окнами», занятыми серовейниково-камышовыми луговинами, в составе которых также участвуют осока сероватая, сабельник болотный, подмаренник топяной, шлемник обыкновенный, щитовник игольчатый, а по закрайкам преобладает щучка дернистая и сфагновые мхи.

Близ понижений формируются сосновые с елью во втором ярусе черничные зеленомошные леса, в которых диаметр сосен достигает 45-50 см при высоте до 26-28 м. В сложении травяно-кустарничкового яруса, кроме черники, принимают участие костяника, марьянник луговой, ожика волосистая, майник, седмичник, брусника, осока пальчатая, вейник тростниковидный, сивец луговой, вероника лекарственная, щитовник распростёртый. Единично встречается пальчатокоренник Фукса (редкий и уязвимый вид, не включенный в Красную книгу Московской области, но нуждающийся на территории области в постоянном контроле и наблюдении). Моховый покров (покрытие до 65 процентов) образован преимущественно плеврозиумом Шребера, видами дикранумов, родобриумом розочковым, полией поникшей. Изредка встречаются сосновые с елью во втором ярусе папоротниково-черничные сфагново-зеленомошные леса. В подобных сообществах отмечена гудайера ползучая – вид, включённый в Красную книгу Московской области.
По более обширным понижениям отмечаются серии сообществ от елово-пушистоберёзовых влажнотравных лесов в краевых частях до тростниковых зарослей в центральной части близ русла временного водотока. Елово-пушистоберёзовые влажнотравные леса характеризуются сомкнутостью крон 0,5-0,6 при высоте древостоев 15-18 м. В сложении травяно-кустарничкового яруса принимают участие таволга вязолистная, щучка, тиселинум болотный, камыш лесной, сабельник болотный, хвощ лесной, бодяк болотный, зюзник европейский, калужница болотная; изредка – купальница европейская (редкий и уязвимый вид, не включенный в Красную книгу Московской области, но нуждающийся на территории области в постоянном контроле и наблюдении). Пятнами встречается сфагновые мхи (максимальное покрытие – 35-40 процентов). Ближе к центру понижения (руслу временного водотока) формируются разреженные (сомкнутость до 0,3-0,4) пушистоберёзовые закустаренные тростниковые леса. Густой (проективное покрытие до 60-65 процентов) подлесок образован, главным образом, ивой пепельной при участии ивы козьей и крушины ломкой. В травяном ярусе абсолютно доминирует тростник. Вдоль русла временного водотока идут полосы тростниковых зарослей. Среди них встречаются своеобразные небольшие «окна», где в травяном покрове заметную роль начинают играть вейник сероватый, хвощ лесной, сабельник, подмаренник топяной, осока пузырчатая.

В центральной части территории отмечаются участки, прилегающие к крупным ложбинам, с существенным участием липы. С ними связаны осиново-берёзово-еловые с липой и липово-осиново-еловые широкотравно-черничные и широкотравно-вейниково-черничные леса. Местами наблюдается обильный подрост ели до 10-12 м высотой.

Реже встречаются липовые с берёзой и елью широкотравные (преимущественно – волосистоосоковые) леса. Сомкнутость крон в них достигает 0,6-0,7 при высоте лип до 25-26 м и диаметрах до 30-35 см. Также обильным бывает подрост ели и липы. В сложении травяно-кустарничкового яруса принимают участие осока волосистая, зеленчук жёлтый, копытень, живучка ползучая, звездчатка жестколистная, чина весенняя, подмаренник промежуточный, сныть, щитовник мужской, щитовник игольчатый, кислица, майник, вейник тростниковидный, костяника, ландыш майский,.

На части заказника, затронутой вспышкой короеда-типографа, сформировались заросли кустарников, местами с сохранившимися фрагментами древостоев. Отмершие деревья ели большей частью сломаны ветром. Сохранившиеся фрагменты древостоя, как правило, имеют общую сомкнутость не более 0,2-0,3. Выделяются два «высотных уровня» – высотой 28-29 м из сосны с участием берёзы повислой (сомкнутостью 0,1-0,2) и высотой 12-14 м с преобладанием выживших елей с участием липы (сомкнутостью 0,2-0,3). Местами обилен подрост дуба. Густой кустарниковый ярус с образован преимущественно малиной и рябиной. Реже встречаются ивы козья и пепельная, изредка – волчеягодник обыкновенный (редкий и уязвимый вид, не включенный в Красную книгу Московской области, но нуждающийся на территории области в постоянном контроле и наблюдении). Основу травяного покрова составляют щучка дернистая, хвощ лесной, иван-чай узколистный. Также довольно обильны бывают кочедыжник женский, земляника лесная, крапива двудомная, вейники наземный и тростниковидный, недотрога мелкоцветковая, изредка встречается ландыш майский.

На участках, где короедом и последующим ветроломом пройдены леса с участием липы, сохранились единичные деревья липы, берёзы и осины. Отмечается обильный подрост ели и рябины, местами – липы. В травно-кустарничковом ярусе ведущая роль принадлежит осоке волосистой, вейнику тростниковидному, зеленчуку жёлтому, звездчатке жёстколистной, щитовнику игольчатому, копытню; реже – чернике.

В полосе на севере территории заказника, примыкающей к СНТ на луговинах антропогенного происхождения наблюдается смесь сорных (в том числе «убежавших» с садовых участков), лесных и луговых видов (сныть, крапива двудомная, бодяк разнолистный, ситник скученный, гравилаты городской и речной, зверобой пятнистый, лютик ползучий, вейник наземный, черника, дудник лесной, земляника лесная, подорожник большой). Местами бывают довольно обильны агрессивные чужеродные виды: золотарники гигантский и канадский, люпин многолистный, мелколепестники канадский и однолетний.