На территории заказника имеются пещеры: Игнатьевская, Колокольная, Эссюмская, скала "Кольцо", суходол реки Сим, Серпиевский карстовый участок. Уникальностью данных объектов является то, что во многих из них обнаружены материальные следы пребывания здесь первобытных людей различных исторических эпох. Игнатьевская пещера является историко-культурным памятником федерального значения. Особенностью заказника является наличие карстовых пещер, которые являются местом массовой зимовки рукокрылых.